Biologie
Biologie moléculaire & biochimie
Séquences, amorces, protéines et calculs biochimiques.
- Analyseur de séquence ADNAnalysez une séquence ADN : composition en bases, taux GC, complément et complément inverse, avec prise en charge des codes IUPAC ambigus.
- Calculateur d'amorces PCRAnalysez et comparez deux amorces PCR : longueur, GC, Tm, GC clamp, homopolymères, complémentarité, risque de dimères et d’épingle.
- Détecteur d'ORF (cadres ouverts de lecture)Détectez les cadres ouverts de lecture (ORF) d'une séquence ADN sur les six cadres : position, longueur, protéine, gestion des bases ambiguës.
- Température de fusion d'une amorce ADN (Tm)Calculez la Tm d'une amorce ADN par le modèle thermodynamique plus-proche-voisin (SantaLucia, 1998), avec les formules empiriques classiques en comparaison.
- Traducteur ADN → protéineTraduisez une séquence ADN en protéine dans l'un des six cadres de lecture (+1, +2, +3, −1, −2, −3) : codons, acides aminés en 1 ou 3 lettres, codons stop.