Biologie
Biologie moléculaire, génétique, microbiologie et culture cellulaire.
Biologie moléculaire & biochimie
6 outils
- Analyseur de séquence ADNAnalyse d’une séquence ADN : composition en bases, taux GC, complément et complément inverse, codes IUPAC ambigus pris en charge.
- Calculateur d'amorces PCRAnalyse et comparaison de deux amorces PCR : longueur, GC, Tm, GC clamp, homopolymères, complémentarité, risque de dimères et d'épingle.
- Concentration et pureté ADN/ARN (A260)Absorbance à 260 nm en concentration (ng/µL), et pureté lue aux rapports 260/280 et 260/230, avec leurs seuils.
- Détecteur d'ORF (cadres ouverts de lecture)Cadres ouverts de lecture (ORF) d'une séquence ADN sur les six cadres : position, longueur, protéine, bases ambiguës gérées.
- Température de fusion d'une amorce ADN (Tm)Tm d'une amorce ADN par le modèle thermodynamique plus-proche-voisin (SantaLucia, 1998), avec les formules empiriques en comparaison.Provisoire
- Traducteur ADN → protéineSéquence ADN traduite en protéine dans l'un des six cadres (+1, +2, +3, −1, −2, −3) : codons, acides aminés en 1 ou 3 lettres, codons stop.
Génétique
3 outils
- Échiquier de PunnettÉchiquier d’un croisement mono ou dihybride : proportions génotypiques et phénotypiques, du 3:1 au 9:3:3:1.
- Équilibre de Hardy-WeinbergFréquences alléliques et génotypiques (p² + 2pq + q² = 1) depuis le phénotype récessif, l’allèle ou les effectifs observés.
- Simulateur de dérive génétique (Wright-Fisher)Dérive génétique simulée : dix populations de Wright-Fisher à graine reproductible, hétérozygotie H₀(1 − 1/2N)^g, bilan fixé, perdu ou en dérive.Provisoire
- Comptage UFC et dilutions décimalesDes colonies comptées à la concentration (UFC/mL), ou la dilution décimale qui rend une boîte comptable (30 à 300).
- Numération cellulaire (chambre de comptage)Comptage en chambre (Neubauer, Malassez) en cellules/mL, avec la viabilité au bleu trypan et l’incertitude de Poisson.
- Temps de génération bactérienTemps de génération d’une culture depuis deux comptages, population après une durée, ou temps pour atteindre une cible.