Biologie moléculaire & biochimie
Séquences, amorces, protéines et calculs biochimiques.
- Analyseur de séquence ADNAnalyse d’une séquence ADN : composition en bases, taux GC, complément et complément inverse, codes IUPAC ambigus pris en charge.
- Calculateur d'amorces PCRAnalyse et comparaison de deux amorces PCR : longueur, GC, Tm, GC clamp, homopolymères, complémentarité, risque de dimères et d'épingle.
- Concentration et pureté ADN/ARN (A260)Absorbance à 260 nm en concentration (ng/µL), et pureté lue aux rapports 260/280 et 260/230, avec leurs seuils.
- Détecteur d'ORF (cadres ouverts de lecture)Cadres ouverts de lecture (ORF) d'une séquence ADN sur les six cadres : position, longueur, protéine, bases ambiguës gérées.
- Température de fusion d'une amorce ADN (Tm)Tm d'une amorce ADN par le modèle thermodynamique plus-proche-voisin (SantaLucia, 1998), avec les formules empiriques en comparaison.Provisoire
- Traducteur ADN → protéineSéquence ADN traduite en protéine dans l'un des six cadres (+1, +2, +3, −1, −2, −3) : codons, acides aminés en 1 ou 3 lettres, codons stop.